答：在税务数字账户中完成勾选抵扣操作后，点击【发票业务】-【发票勾选确认】-【抵扣类勾选】-【统计确认】进行抵扣勾选统计确认操作，再进行增值税申报。在《增值税及附加税费申报表附列资料(二)》(以下简称《附列资料二》)，相应栏次填写进项金额，主表会自动带入相应数据。
(一)农产品收购发票或自产农产品销售发票按9%扣除率计算抵扣的，可抵扣税额填入《附列资料二》第6栏；
(二)代开3%农产品专票按9%抵扣填入《附列资料二》第6栏；
(三)9%专用发票，可抵扣税额填入《附列资料二》第2栏；
(四)3%专用发票按扣除率9%计算抵扣的，可抵扣税额填入《附列资料二》第6栏；若按票面税额抵扣填入第2栏；
(五)海关进口增值税专用缴款书，可抵扣税额填入《附列资料二》第5栏。
(六)已进行“加计扣除勾选”对应的税额，填入《附列资料二》第8a栏。
